• לכל אחד מהסגולות שנכתוב בעזרת ה', יש צורך לכוון לפני כן שזה כנגד תיקון היסוד.
• סגולה להישמר מפגם הברית, לא להניח על גופו ברזל. משום שכתוב לגבי מזבח כפרה "לא תניף עליהם ברזל" והמזבח כנגד הברית קודש, כידוע.
• יזהר האדם לא להביט בפניו של אדם רשע או גוי, משום שגורם נזק לנשמתו.
• סגולה שלא יגיע לידי פגם בברית קודש, שלא יסתכל בברית חבירו, ואפילו במקווה. וכתב השומר אמונים שהפגם אשר פוגם בעיניים בראותו לברית חבירו גדול מאשר הטבילה במקווה.
• בשעה שנולד לאדם בן או בת, ומלבישים לבן בגד של בת, או לבת בגד של בן, גורם שיהיו להם יצר הרע של עריות ושיפגמו בברית קודש, לכן צריך להקפיד בבגד הראשון שילבשו שיהיה לפי מין הנולד.
• רבינו האר"י ז"ל כתב סגולה לתיקון פגם היסוד, שישתדל להזיע בקיום המצוות. על כן, אדם שחופר לנפטר קבר ומזיע אולהבדיל רוקד בשמחת תורה ומזיע, הרי זה תיקון ליסוד.
• הנועם אלימלך אומר, שתיקון ליסוד, לקרוא ג' פעמים את כל התהילים ברציפות. ובשם צדיקים הוסיפו שיותר טוב לקרוא את כל התהילים ג' פעמים בשבת קודש.
• עשיית זימון על כוס ברכת המזון היא תיקון גדול לפגם הברית. ועל פי סוד יש לאוחזו על ידי חמשת אצבעותיו כשושנה בין החוחים.
• הבבא מאיר זצוק"ל אומר בשם רבינו האר"י ז"ל, שלתקן חטא זרע לבטלה אחד, צריך להתענות פ"ד ימים. ואומר הבבא מאיר זצוק"ל שכיום הדורות חלשים ועל כן, יפדה את התענית בכסף. בערך הסעודות שעושה בכל יום ויכפיל במספר ימי התעניות.
• הרב בעל ספר נתיבות שלום אומר, שתלמיד חכם שלא יוכל לפדות בממון או להתענות, ילמד תורה 5 שעות רצוף בגמרא. וזה שווה כמו צום של 40 יום. והבן איש חי הקדוש כותב ששעת לימוד בשבת קודש, שווה כ 1000 שעות לימוד ביום חול.
• אשה שהחטיאה אדם בפגם הברית, אין לה לקחת כסף מבעלה ולשלם לפדיון, משום שמה שקנתה אשה קנה בעלה. אולם היא צריכה לעשות תשובה. וטוב שיתאספו קבוצת נשים לקריאת תהילים אחר חצות לילה ולקרוא עד הבוקר וזהו סגולה לנשים לתיקון הפגם, אולם יעשו זאת בצניעות.